海光化学药物研究所

主要致力于质子泵抑制剂（PPI）、抗肿瘤、糖尿病和深度感染类化学药品的研究开发及放大、转化，秉承公司“创新、合作、当责”的新企业价值观，以化药的仿创结合为基础，同时不断拓展创新药物研究领域。

靶向药物研究所

江苏省第一家由企业自主筹建的靶向药物研究机构，同时作为江苏省靶向抗肿瘤药物工程中心，承担着多项“重大新药创制”国家科技重大专项课题。

靶向药物研究所主要致力于靶向创新剂型的研究，已建有抗肿瘤靶向脂质体、纳米复合物、局部靶向性长效注射微粒等纳、微米制剂研发平台,并拥有独立的知识产权，研发的新药产品已申报临床研究。

手性药物研究所 

奥赛康与中国科学院上海有机化学研究所联合建立，主要从事手性药物产业化，新型手性中心构建方法，制剂研发中的手性转变等方面研究。

手性药物研究所旨在有效融合学术界和企业界各自的优势，推动技术成果转化，解决本公司和行业共性技术问题、关键技术难点和配套技术问题，促进手性制药技术及绿色制药技术的发展。